martes, febrero 22, 2011

KEGG: 1437 GENOMAS SECUENCIADOS DE ORGANISMOS EUCARIOTAS, BACTERIAS Y ARCHAEAS A FEBRERO 2011

EUCARIOTAS: 157 (17 aún en borrador)
BACTERIAS: 1185 (ver fuente)
ARCHAEAS: 95 (ver fuente)

GENOMAS COMPLETOS DE ORGANISMOS EUCARIOTAS

ANIMALES VERTEBRADOS (23)
MAMÍFEROS (13)
hsa - Homo sapiens (humano)
ptr - Pan troglodytes (chimpance)
pon - Pongo abelii (orangután de Sumatra)
mcc - Macaca mulatta (mono rhesus)
mmu- Mus musculus (ratón)
rno - Rattus norvegicus (rata)
cfa - Canis familiaris (perro)
aml - Ailuropoda melanoleuca (panda gigante)
bta - Bos taurus (vaca)
ssc - Sus scrofa (cerdo)
ecb - Equus caballus (caballo)
mdo - Monodelphis domestica (zarigüeya)
oaa - Ornithorhynchus anatinus (ornitorrinco)
AVES (02)
gga - Gallus gallus (gallo)
tgu - Taeniopygia guttata (pinzón cebra)
ANFIBIOS (02)
xla - Xenopus laevis (rana de uñas africana)
xtr - Xenopus tropicalis (rana de uñas occidental)
PECES (04)
dre - Danio rerio (pez cebra)
dfru - Fugu rubripes (pez globo tigre)
dtni - Tetraodon nigroviridis (pez globo verde)
dola - Oryzias latipes (pez del arroz)
CEFALOCORDADOS (01)
bfo - Branchiostoma floridae (anfioxus florida)
TUNICADOS (01)
cin - Ciona intestinalis (ascidia)

ANIMALES INVERTEBRADOS (33)

EQUINODERMOS (01)
Spu - Strongylocentrotus purpuratus (erizo de mar púrpura)

ARTRÓPODOS (25)
INSECTOS (23)
dme - Drosophila melanogaster (mosca de la fruta)
dpo - Drosophila pseudoobscura pseudoobscura (mosca de la fruta)
dan - Drosophila ananassae (mosca de la fruta)
der - Drosophila erecta (mosca de la fruta)
dpe - Drosophila persimilis (mosca de la fruta)
dse - Drosophila sechellia (mosca de la fruta)
dsi - Drosophila simulans (mosca de la fruta)
dwi - Drosophila willistoni (mosca de la fruta)
dya - Drosophila yakuba (mosca de la fruta)
dgr - Drosophila grimshawi (mosca de la fruta)
dmo - Drosophila mojavensis (mosca de la fruta)
dvi - Drosophila virilis (mosca de la fruta)
aga - Anopheles gambiae (mosquito)
aag - Aedes aegypti (mosquito de la fiebre amarilla)
cqu - Culex quinquefasciatus (mosquito doméstico del sur)
ame - Apis mellifera (abeja de la miel)
nvi - Nasonia vitripennis (avispa de joya)
dbmo- Bombyx mori (gusano de seda)
tca - Tribolium castaneum (escarabajo rojo de la harina)
api - Acyrthosiphon pisum (áfido de la arveja)
dapi - Acyrthosiphon pisum (áfido de la arveja)
phu - Pediculus humanus corporis (piojo del cuerpo humano)
dphu- Pediculus humanus (piojo del cuerpo humano)
CRUSTÁCEO (01)
ddpu- Daphnia pulex (pulga de agua)
ÁCARO (01)
isc - Ixodes scapularis (garrapata de patas negras)

NEMÁTODOS (03)
cel - Caenorhabditis elegans
cbr - Caenorhabditis briggsae
bmy - Brugia malayi (filaria)

PLATELMINTO (01)
smm- Schistosoma mansoni

CNIDARIOS (02)
nve - Nematostella vectensis (anémona de mar)
hmg - Hydra magnipapillata

PLACOZOO (01)
tad - Trichoplax adhaerens

PLANTAS (17)

DICOTILEDONEAS (06)
ath - Arabidopsis thaliana (berro de thale)
dlja - Lotus japonicus (loto)
dmtr Medicago truncatula (leguminosa)
pop - Populus trichocarpa (álamo negro)
rcu - Ricinus communis (higuerilla)
vvi - Vitis vinifera (uva de vinificación)
MONOCOTILEDONEAS (05)
osa - Oryza sativa japonica (arroz japonés)
dosa- Oryza sativa japonica (RAPDB) (arroz japonés)
dbdi - Brachypodium distachyon (forraje)
sbi - Sorghum bicolor (sorgo)
zma - Zea mays (maíz)
MUSGOS (01)
ppp - Physcomitrella patens subsp. Patens (musgo)
ALGAS (05)
cre - Chlamydomonas reinhardtii (alga verde)
vcn - Volvox carteri f. nagariensis (alga verde)
olu - Ostreococcus lucimarinus (alga verde)
ota - Ostreococcus tauri (alga verde)
cme - Cyanidioschyzon merolae (alga roja)

HONGOS (52)

ASCOMICETOS (42)
sce - Saccharomyces cerevisiae (levadura de gemación)
dsrd- Saccharomyces paradoxus (levadura)
dsmi- Saccharomyces mikatae (levadura)
dsba- Saccharomyces bayanus (levadura)
ago - Ashbya gossypii (Eremothecium gossypii) (levadura)
kla - Kluyveromyces lactis (levadura)
lth - Lachancea thermotolerans (levadura)
dkwa- Kluyveromyces waltii (levadura)
ppa - Pichia pastoris (levadura)
vpo - Vanderwaltozyma polyspora (levadura)
zro - Zygosaccharomyces rouxii (levadura)
cgr - Candida glabrata (levadura)
dha - Debaryomyces hansenii (levadura)
pic - Pichia stipitis (levadura)
pgu - Pichia guilliermondii (levadura)
lel - Lodderomyces elongisporus (levadura)
cal - Candida albicans (levadura)
ctp - Candida tropicales (levadura)
cdu - Candida dubliniensis (levadura)
yli - Yarrowia lipolytica (levadura)
clu - Clavispora lusitaniae (levadura)
ncr - Neurospora crassa (hongo filamentoso)
pan - Podospora anserina (hongo filamentoso)
mgr - Magnaporthe oryzae (hongo filamentoso)
fgr - Fusarium graminearum (hongo filamentoso)
ssl - Sclerotinia sclerotiorum (hongo filamentoso)
bfu - Botryotinia fuckeliana (hongo filamentoso)
ani - Aspergillus nidulans (hongo filamentoso)
dani- Aspergillus nidulans (AspGD) (hongo filamentoso)
afm - Aspergillus fumigatus (hongo filamentoso)
nfi - Neosartorya fischeri (hongo filamentoso)
aor - Aspergillus oryzae (hongo filamentoso)
ang - Aspergillus niger (hongo filamentoso)
afv - Aspergillus flavus (hongo filamentoso)
act - Aspergillus clavatus (hongo filamentoso)
pcs - Penicillium chrysogenum (hongo filamentoso)
cim - Coccidioides immitis (hongo filamentoso)
cpw - Coccidioides posadasii (hongos dimórficos)
ure - Uncinocarpus reesii (hongo filamentoso)
pno - Phaeosphaeria nodorum (hongo filamentoso)
tml - Tuber melanosporum (hongos periteciales)
spo - Schizosaccharomyces pombe (levadura de fisión)
BASIDIOMICETOS (10)
cne - Cryptococcus neoformans JEC21 (hongo levaduriforme)
cnb - Cryptococcus neoformans B-3501A (hongo levaduriforme)
ppl - Postia placenta (hongo levaduriforme)
dpch- Phanerochaete chrysosporium (seta)
lbc - Laccaria bicolor (seta)
mpr - Moniliophthora perniciosa (seta)
cci - Coprinopsis cinerea (seta)
scm - Schizophyllum commune (seta)
uma - Ustilago maydis (seta)
mgl - Malassezia globosa (seta)

PROTISTAS (32)

MICROSPORIDIOS (01)
ecu - Encephalitozoon cuniculi
COANOFLAGELADOS (01)
mbr - Monosiga brevicollis (monosiga)
AMEBAFLAGELADOS (01)
ngr - Naegleria gruberi (ameba flagelada)
DICTYOSTELIO (01)
ddi - Dictyostelium discoideum (moho plasmodial del barro)
AMEBAS (02)
ehi - Entamoeba histolytica (entamoeba)
edi - Entamoeba dispar (entamoeba)
APICOMPLEXOS (14)
pfa - Plasmodium falciparum 3D7 (plasmodio)
pfd - Plasmodium falciparum Dd2 (plasmodio)
pfh - Plasmodium falciparum HB3 (plasmodio)
pyo - Plasmodium yoelii (plasmodio)
pcb - Plasmodium chabaudi (plasmodio)
pbe - Plasmodium berghei (plasmodio)
pkn - Plasmodium knowlesi (plasmodio)
pvx - Plasmodium vivax (plasmodio)
tan - Theileria annulata (theileria)
tpv - Theileria parva (theileria)
bbo - Babesia bovis (babesia)
cpv - Cryptosporidium parvum (criptosporidio)
cho - Cryptosporidium hominis (criptosporidio)
tgo - Toxoplasma gondii (toxoplasma)
CILIADOS (02)
tet - Tetrahymena thermophila (tetrahymena)
ptm - Paramecium tetraurelia (paramecio)
KINETOPLASTIDOS (05)
tbr - Trypanosoma brucei (tripanosoma)
tcr - Trypanosoma cruzi (tripanosoma)
lma - Leishmania major (leishmania)
lif - Leishmania infantum (leishmania)
lbz - Leishmania braziliensis (leishmania)
DIPLOMONADA (01)
gla - Giardia lamblia (giardia)
PARABASALIDO (01)
tva - Trichomonas vaginalis (tricomona)
DIATOMEAS (02)
pti - Phaeodactylum tricornutum
tps - Thalassiosira pseudonana
OOMICETO (01)
pif - Phytophthora infestans (rancha)



FUENTE:
http://www.genome.jp/kegg/catalog/org_list.html

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